• 序列比对工具

    比较两条 DNA 或蛋白质序列的相似性(基于 Needleman-Wunsch 全局比对算法)

    序列比对工具
    本工具使用 Needleman-Wunsch 全局比对算法(Gotoh 仿射空位罚分),参数与 EMBOSS Needle / VectorBuilder 一致:DNA 使用 EDNAFULL 替换矩阵,蛋白质使用 EBLOSUM62 替换矩阵,默认空位开放罚分 2、空位延伸罚分 2,可在上方输入框中修改。
    支持 DNA 比对、蛋白质比对以及蛋白质序列的 DNA 比对三种模式,支持 FASTA 格式输入,最大序列长度 10,000。"蛋白质序列的 DNA 比对"模式下,可分别选择两条序列的读码框(编码框1/2/3)。
    !使用说明:选择比对类型,填入两条序列(支持 FASTA 格式,会自动去除标题行和空白),翻译模式下可指定读码框,点击"比对"按钮即可。

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