染色质免疫共沉淀（ChIP）试剂盒

参考文献中已报道的靶基因结合序列，或使用在线软件（如ECR Browser或MEME等）分析目的基因启动子序列。

建议设置阴性对照组、阳性对照组、实验组、input组、无抗体对照组。

建议优先选择CHIP/CHIP-Seq验证后的抗体，提高实验的成功率。优宁维提供多种CHIP/CHIP-Seq验证货号。不建议使用WB验证抗体开展CHIP实验，可以尝试IHC/IF验证抗体，但没有售后保障。

磁珠法搭配磁力架使用，有更方便高效的洗涤效率，更好的富集度和更低本底信号，且磁珠法可以避免来自封闭用DNA的本底信号，适用后续ChIP-Seq实验。

酶处理温和，不易变性，损伤小，片段为1-3个核小体，处理更均一，方法相对简单。酶解法有一定的局限性：对于转录因子来说，因为DNA结合区域覆盖多个核小体，酶切法会将结合区打碎；酶切的位点主要在核小体之间，不适合位点位于核小体间DNA linker处（P53）；酶切条件37°C可能会导致蛋白表位的降解。超声法快速有效，更适用于转录因子，但超声条件需要摸索。

本试剂盒配的阳性对照抗体为RNA 聚合酶 II 抗体，对照引物为人的GAPDH引物序列。如果样本为小鼠，需要自行合成小鼠GAPDH对照引物。本试剂盒阴性对照抗体为Normal Mouse IgG，阴性对照抗体要根据您目标蛋白一抗的种属来源选择，推荐阴性对照抗体和目的蛋白抗体选择同一种属来源。

超声后的染色质片段大多在200-1000bp范围内的弥散条带是比较好的超声结果。

探头式、震荡式和水浴式超声仪均适用于CHIP实验超声处理，但是不同的仪器、细胞类型和细胞密度，超声的条件和超声结果差别较大。实验前需要进行超声功率和时间的优化。超声功率建议做几个梯度，比如10%-60%，或100W-400W。超声时间也需要做几个梯度，比如1min-5min，这个是指超声总时长，不包括间隔时间。注意超声要在冰上进行，且要设计时断时续的超声程序，保证低温；探头式超声仪的探头要尽量深入管中，但不接触管底或侧壁，以免产生泡沫；总超声时间也不要太长，以免蛋白降解。

建议在平时培养细胞（非实验）时，细胞长到80-90%密度时对细胞进行计数，实验时可根据细胞密度大致判断细胞数量。